農村合作醫療是醫保的一種。

醫保包括城鎮職工基本醫療保險、新型農村合作醫療、城鎮居民基本醫療保險、商業醫療保險。

醫保擁有農村合作社的全部特性，農村合作醫療只具有醫保的一部分特性。

醫保是為所有勞動者提供保障的，農村合作醫療是專門為農民提供保障的。勞動者可以是工人、農民、城鎮居民、在職員工，而農村合作醫療只能為農民服務。

醫保是由國家和社會為勞動者提供保障的，而農村合作醫療主要是由國家為農民提供保障。

農村合作醫療的繳費便宜，加上國家的大力補助，農民一年繳納費用很低，卻能得到很大的醫療保障。

農村合作醫療主要是以大病統籌為主，小病由農民支出，而醫保并不以哪種疾病為主。