天然瑪瑙和假冒產品的最顯著的區別，就是橫斷面有沒有同心層紋結構。然而，整塊瑪瑙較為容易識別，而經切割后的制成品，沒有明顯整齊的圖案，容易認錯。但一般來說，天然瑪瑙手感涼，表面像涂了一層蠟，并有蠟的光澤;半透明;硬度在莫氏7級以上，用小刀刻不動;由于它是在溶融狀態下形成的結晶體，多為球狀(如雨花石)，特別致密，表面研磨后更為細膩，可在硬雜木板上急驟地摩擦十幾下，一般真瑪瑙不熱，木板卻發燙;顏色常是多種色彩混雜于一塊瑪瑙中，形成美麗的花紋、層紋、錦花等絢麗多彩的圖案。

假瑪瑙除人工合成外，一部分是用美麗優質的石材來充當。其基本特征是：手感固然涼，卻沒有蠟狀感覺和光澤;硬度低于莫氏5級以下，用小刀能刻出痕跡來;砸碎觀察斷面，除沒有瑪瑙所具有的層紋外，顆粒較粗，甚至有裂隙，不透明;顏色之間界限分明;不同顏色的比重相差很大，主要是成分含量所致。另外，對一些在假瑪瑙表面粘上一層薄薄的有機物，仿佛蠟狀光澤的手感也要注意。