水晶本身有一定的記憶力，她會吸收開采和加工者一些不好的運氣或是別的，所以新買的水晶要用專業的方法消磁。水晶戴久了，或是使用水晶療法，容易吸引負性能量，所以也要做水晶的凈化，也有人稱水晶消磁，可以幫助水晶恢復原來的磁場。

浸泡法：

將水晶浸泡在礦物質水里二十四小時，自然晾干再戴。此法為最簡單方便且穩妥的消磁方法。

將水晶放在水晶簇(或者紫晶洞)上，讓晶簇(晶洞)發出生生不息的振動能量，清除水晶內負能量及為它重新充電，效果也非常大。

陽光紫外光清洗法：

把水晶礦石放在窗臺邊、陽臺上，利用陽光直接照射。最好在早上到中午前左右的陽光是最適當，約2小時較適宜，如果不小心超過時間也沒關系，但是一定要在日落前收回來。

有些受熱會褪色的寶石，如粉晶、紫水晶，或某些特別鮮艷卻不穩定的顏色，如翠玉、紅寶、紅色電氣石、綠寶石、橙色方解石、粉紅色的芙蓉晶等等，則最好不要使用陽光清潔法。還有，水晶球的球體會將陽光聚焦，形成高溫、高熱，底下若鋪有紙、布、木板等易燃品，恐怕很快會燒起來，造成危險。所以，水晶球在以日光照射法消磁時，要特別小心，最好就換用其他方法來消磁。